Открываем КриптоПро, вкладка Сервис, Просмотреть сертификаты в контейнере, выбрать целевой контейнер и нажать кнопку Установить.
Теперь сертификат ЭЦП добавлен в реестр Личное пользователя.
Главное меню - Администрирование (настройки) - Обмен электронными документами.
Установить галочку электронной подписи (если не стоит).
Переходим по ссылке Настройки электронной подписи и шифрования.
На вкладке сертификаты нажимаем кнопку добавить и выбираем из установленных на компьютере.
Из списка личных сертификатов выбираем нужный, нажимаем кнопку Далее.
Нажимаем Добавить.
После добавления сертификата отрываем его двойным щелчком мыши и нажимаем Проверить.
8. Если эцп находится на Rutoken, то при добавлении подписи необходимо отметить пункт, как на скриншоте.